हेराक्लिओन क्रेते द्वीप का सबसे बड़ा शहर और प्रशासनिक राजधानी है। पुरातत्व संग्रहालय में 4000 साल पुरानी मिनोअन सभ्यता के अवशेष हैं, जो मिनोटौर किंवदंती के साथ पास के पैलेस ऑफ नोसोस के आसपास केंद्रित है। शहर में कई वेनिस और बीजान्टिन चर्च हैं और पूर्वी भूमध्य सागर में सबसे बड़ी अच्छी तरह से संरक्षित 15वीं शताब्दी की वेनिस दीवार और बंदरगाह किला, कौल्स किला है। हेराक्लिओन द्वीप के मध्य में स्थित है और इसलिए इसमें एक व्यस्त बंदरगाह और एक व्यस्त हवाई अड्डा है (इसके 2027 में कस्टेली में स्थानांतरित होने की उम्मीद है) और आमतौर पर क्रेते और आसपास के द्वीपों की यात्राओं के लिए शुरुआती बिंदु है।